Епископ Евмений (Евгений Иванович Михеев) родился 17 мая 1942 года в Кандалакше Мурманской области в старообрядческой семье. В 1954 году переехал в поселок Шувое Егорьевского района Московской области, где жила его бабушка Варвара Михайловна, супруга протоиерея Петра Симеоновича Михеева, настоятеля храма в поселке Шувое, благочинного Московской епархии. По окончании школы, в 1959 году, поступил в Егорьевское ремесленное училище, где овладел профессией столяра, несколько лет проработал на шувойской фабрике. Посещал храмы в Шувое и Егорьевске. С 1967 года исполнял обязанности уставщика в старообрядческом храме Рожества Пресвятыя Богородицы в Орехово-Зуеве.

В декабре 1967 года был рукоположен во чтецы. В 1968 году в Неделю о Фоме чтец Евгений венчался с девицей Евгенией Михайловной Куликовой, а 25 августа рукоположен в сан диакона. В том же году на праздник Рожества Пресвятыя Богородицы по благословению архиепископа Иосифа, Московского и всея Руси, епископ Кишиневский и всея Молдавии Никодим (Латышев) рукоположил диакона Евгения в сан священника. О. Евгений был назначен настоятелем храма в городе Верее Московской области, где и служил на протяжении 36 лет.
В 1971 году приглашён епископом Анастасием (Кононовым) на временное служение в Покровский кафедральный собор в Москве. Служение это, однако, продлилось более 33 лет. Владыка Евмений по праву считается рогожским служителем, поскольку на протяжении нескольких десятилетий безропотно нес на своих плечах череду рогожского священнослужения.
Отец Евгений с матушкой Евгенией вырастили пятерых детей. Двое сыновей, протоиерей Алексий Михеев и иерей Иоанн Михеев, продолжают путь отца, став на священническую стезю, старшая дочь Александра является супругой протоиерея Артемона Шендригайлова.
В 1999 году отец Евгений Михеев овдовел.
20 октября 2004 года на Освященном Соборе РПСЦ избран кандидатом в епископы, а 21 октября там же утверждён кандидатом на замещение вакантной Кишишевской епископской кафедры.
17 ноября 2004 года в Покровском кафедральном соборе на Рогожском кладбище в Москве епископ Киевский и всея Украины Саватий (Козко) совершил иноческий постриг иерея Евгения Михеева с наречением имени Евмений. 2 января 2005 года в Покровском соборе на Рогожском кладбище рукоположен в сан епископа на Кишиневскую епархию Русской Православной Старообряческой Церкви. Хиротонию совершили: митрополит Московский и всея Руси Андриан (Четвергов), епископ Новосибирский Силуян (Килин) и епископ Уссурийский Герман (Савельев).
В субботу 5 февраля 2005 года прибыл на Кишинёвскую кафедру, где до сих пор продолжает архиерейское служение. 19 октября в Покровском кафедральном соборе на Рогожском возведен митрополитом Корнилием в достоинство архиепископа.