Епископ Евмений (Евгений Иванович Михеев) родился 17 мая 1942 года в Кандалакше Мурманской области в старообрядческой семье. В 1954 году переехал в поселок Шувое Егорьевского района Московской области, где жила его бабушка Варвара Михайловна, супруга протоиерея Петра Симеоновича Михеева, настоятеля храма в поселке Шувое, благочинного Московской епархии. По окончании школы, в 1959 году, поступил в Егорьевское ремесленное училище, где овладел профессией столяра, несколько лет проработал на шувойской фабрике. Посещал храмы в Шувое и Егорьевске. С 1967 года исполнял обязанности уставщика в старообрядческом храме Рожества Пресвятыя Богородицы в Орехово-Зуеве.
В декабре 1967 года был рукоположен во чтецы. В 1968 году в Неделю о Фоме чтец Евгений венчался с девицей Евгенией Михайловной Куликовой, а 25 августа рукоположен в сан диакона. В том же году на праздник Рожества Пресвятыя Богородицы по благословению архиепископа Иосифа, Московского и всея Руси, епископ Кишиневский и всея Молдавии Никодим (Латышев) рукоположил диакона Евгения в сан священника. О. Евгений был назначен настоятелем храма в городе Верее Московской области, где и служил на протяжении 36 лет.
В 1971 году приглашён епископом Анастасием (Кононовым) на временное служение в Покровский кафедральный собор в Москве. Служение это, однако, продлилось более 33 лет. Владыка Евмений по праву считается рогожским служителем, поскольку на протяжении нескольких десятилетий безропотно нес на своих плечах череду рогожского священнослужения. Пожалуй, именно он имеет более всего духовных чад среди рогожских прихожан.
Отец Евгений с матушкой Евгенией вырастили пятерых детей. Двое сыновей, протоиерей Алексий Михеев и иерей Иоанн Михеев, продолжают путь отца, став на священническую стезю, старшая дочь Александра является супругой протоиерея Артемона Шендригайлова.
В 1999 году отец Евгений Михеев овдовел.
20 октября 2004 года на Освященном Соборе РПСЦ избран кандидатом в епископы, а 21 октября там же утверждён кандидатом на замещение вакантной Кишишевской епископской кафедры.
17 ноября 2004 года в Покровском кафедральном соборе на Рогожском кладбище в Москве епископ Киевский и всея Украины Саватий (Козко) совершил иноческий постриг иерея Евгения Михеева с наречением имени Евмений. 2 января 2005 года в Покровском соборе на Рогожском кладбище рукоположен в сан епископа на Кишиневскую епархию Русской Православной Старообряческой Церкви. Хиротонию совершили: митрополит Московский и всея Руси Андриан (Четвергов), епископ Новосибирский Силуян (Килин) и епископ Уссурийский Герман (Савельев).
В субботу 5 февраля 2005 года прибыл на Кишинёвскую кафедру, где до сих пор продолжает архиерейское служение. За эти годы епископ Евмений рукоположил двоих дьяконов и пятерых священников, освятил два храма.