Евгений Борисович Чунин родился 26 января 1962 г. в Ленинграде в семье христиан-старообрядцев Бориса Алексеевича(1928 г.р.) и Надежды Ивановны (1936 г.р.) Чуниных.
Святое крещение принял в младенчестве от протоиерея Илии Ближникова (д. Сысоево Бежаницкого района Псковской области) в одной из домашних моленных Петербурга.
В 1979 году окончил среднюю школу и поступил на первый курс дневного отделения электротехнического факультета Ленинградского института инженеров железнодорожного транспорта им. академика В.Н. Образцова (ЛИИЖТ; ныне ПГУПС).
В сентябре 1983 г. сочетался браком с девицей Ириной Даниловной Артемьевой.
В июне 1984 г. успешно защитил диплом инженера по специальности «Электронные вычислительные машины», получил квалификацию «инженер-системотехник» и рекомендацию для поступления в очную аспирантуру. Согласно распределению, в августе 1984 г. поступил на работу инженером на Головной вычислительный центр ЛИИЖТа.
29 марта 1987 г. по ходатайству прихожан храма во имя Покрова Пресвятой Богородицы в Санкт-Петербурге рукоположен в сан диакона к этому храму . По окончании трехлетнего срока работы по распределению уволился из вычислительного центра и всецело посвятил себя церковному служению.
5 июля 1987 г. по ходатайству ржевских прихожан получил благословение митрополита Алимпия (Гусева) на временное священнослужение в храме Покрова Пресвятыя Богородицы в г. Ржеве. Несмотря на значительное расстояние, диакону Евгению удавалось совмещать поездки в Ржев и службу петербургском храме.
На протяжении 1987–1989 гг. прихожане санкт-петербургского храма продолжали активно ходатайствовать перед митрополитом Алимпием о поставлении диакона Евгения в сан священника к их храму. Священническая хиротония состоялась 12 ноября 1989 г., однако архиерейское решение о месте служения было иным — сам о. Евгений только через пять дней узнал, что местом его служения будет г. Ржев. Он также получил для окормления расположенный не так далеко от Ржева приход г. Сычёвка.
В мае 1990 года по благословению епископа Лукиана (Абрамкина) начал строительство нового деревянного храма в Сычевке. Здесь в июле 1990 г. при участии епископа Лукиана был заложен храм во имя свв. мчч. Флора и Лавра.
28 ноября 1991 г. во Ржеве епископ Лукиан созывает епархиальное совещание Клинцовской и Ржевской епархии. На этом совещании иерея Евгения Чунина избирают секретарем епархиального управления Клинцовской и Ржевской епархии.
В 1992 году о. Евгений передает сычевский храм на попечение новопоставленного о. Сергия Лисуренко, а сам углубляется в труды во ржевском приходе.
Весной 1993 г. выступил с инициативой создания загородного детского христианского лагеря и по благословению епископа Лукиана (Абрамкина) приступил к трудам по его созиданию. Летом 1994 г. на участке под Ржевом состоялся первый сезон детского лагеря; положено начало ежегодной летней воспитательной работе. С тех пор на протяжении 1994–2019 гг. детский лагерь «Ржевская обитель» каждое лето проводит по 3–6 детских и подростковых смен различного профиля. Позже детский христианский лагерь получил название «Молодежный культурно-образовательный центр «Ржевская обитель».
В октябре 1998 г. в связи с назначением о. Сергия Лисуренко настоятелем храма Остоженской общины в Москве повторно спустя 6 лет принимает на себя окормление старообрядческой общины в Сычевке.
5 октября 1999 г. по совместительству со служением во Ржеве и Сычевке избран председателем новообразованной Тверской православной старообрядческой общины. С этих пор возглавил усилия прихожан г. Твери по поиску и устроению своего храма в областном центре.
15 февраля 2004 года распоряжением митрополита Андриана (Четвергова) назначен на должность управляющего делами Московской Митрополии РПСЦ с сохранением должности настоятеля храма Покрова Пресвятыя Богородицы во Ржеве и иконома Клинцовско-Ржевской епархии.
24 июля 2004 года возведен в достоинство протоиерея.
9 января 2005 г. на епархиальном съезде в Санкт-Петербурге назначен благочинным приходов Тверской и Смоленской областей.
В июне 2005 года на заседании Учебного совета РПСЦ под председательством митрополита Андриана избран директором Московского старообрядческого духовного училища.
В 2008 г. принял поручение митрополита Корнилия по представлению интересов старообрядческой Церкви в деятельности Межведомственного консультативного совета по апробации и введению курса ОРКСЭ при Министерстве образования и науки РФ, исполнял это поручение вплоть до 2014 г.
5 августа 2009 года по личному распоряжению митрополита Корнилия освобожден от должности управляющего делами Московской Митрополии РПСЦ «в связи с сокращением указанной должности».
17 июня 2011 г. на епархиальном съезде Санкт-Петербургской и Тверской епархии под председательством митрополита Корнилия на основании личного ходатайства освобожден от должности иконома епархии с сохранением в должности благочинного старообрядческих приходов Тверской и Смоленской областей.
16 июня 2014 г. по распоряжению митрополита Корнилия освобожден от должности директора Московского старообрядческого духовного училища.
С 2014 года о. Евгений смог более глубоко погрузиться в жизнь прихода. Расширил свою работу культурно-образовательный центр «Ржевская обитель«. «Обитель» провела свои первые смены как летний палаточный лагерь для детей. Со временем гостей стали размещать в домиках. С 2014 года среди гостей были уже не только дети — отдельные образовательные смены стали проводить для молодёжи, причем не только в летний период, но и в зимние каникулы. В 2020 году на территории центра была возведена часовня. Сегодня центр проводит в год три детские смены, зимний молодежный слет, летние образовательную и паломническую смены.
Ржевская община регулярно выпускает газету «Покровский вестник». Отец Евгений является главным ее редактором. Как и другие проекты общины, газета сплачивает трудящихся над ней ржевитян и служит духовному просвещению многих: издание получают во многих приходах России.
Трудами о. Евгения в 2020 году при храме открыт Музей древлеправославной культуры при Покровском старообрядческом храме. Храм входит в список посещаемых объектов общегородских экскурсий и знакомит гостей с историей старообрядчества Ржева.
Отец Евгений является автором нескольких просветительских изданий, в торм числе Учебного молитвослова, брошюры «Таинство покаяния». Вместе с супругой Ириной о. Евгений воспитал семерых детей, двое из которых также вступили на путь священнослужения — иерей Димитрий Чунин стал настоятелем храма в Сычёвке, иерей Герман Чунин — настоятелем храма свт. Николы на Вятке.
