Алексей Евгеньевич Михеев родился 26 мая 1972 года в г. Верея Московской области.

20 декабря 1987 г. архиепископ Алимпий (Гусев) совершил поставление отрока Алексея во чтецы.
В Верейском Покровском храме 31 мая 1998 г. состоялось венчание чтеца Алексея Михеева и девицы Ирины Думновой, таинство совершил духовный отец пары иерей Виктор Жельцов.
Благословением митрополита Алимпия с ноября 1998 г. чтец Алексей направлен на служение в Никольский храм д. Устьяново Московской области в качестве уставщика.
23 ноября 1999 г. состоялась диаконская хиротония Алексея Михеева, а через три недели, 14 ноября 1999 г., митрополит Алимпий рукоположил его во иереи.
В 2007 г. митрополитом Корнилием иерей Алексей назначен икономом Московской епархии; 22 июня 2007 г. распоряжением митрополита Корнилия включен в состав Комиссии по частным вопросам.
В 2012 году праздник свв. жен-мироносиц в Москве украсило возведение о. Алексея Михеева в сан протоиерея.
16 ноября 2017 г. на совещании Московской епархии протоиерей Алексей освобожден от обязанностей иконома епархии и избран заместителем благочинного приходов Московской области.
27 ноября 2019 г. на совещании Московской епархии избран благочинным приходов Московской области.
В семье Михеевых четверо детей. Последние несколько лет о. Алексей духовно окормляет студентов Московского старообрядческого духовного училища.
6 июня 2021 года предстоятель Церкви митрополит Корнилий огласил свое благословение протоиерею Алексею Михееву служить настоятелем Покровского кафедрального собора на Рогожском.