Первый день работы Собора, 17 октября, был посвящен решению организационных вопросов, утверждению повестки дня и началу обсуждения включенных в нее тем. Ведущими Собора избраны протоиерей Геннадий Чунин и иерей Иоанн Ошин. Важными решениями первого дня стало поручение временного окормления Донской и Кавказской епархии епископу Андрею (Кладиеву), а Санкт-Петербургской и Тверской епархии — епископу Евфимию (Дубинову). Квота Рогожской общины для участия в Соборе от мирян увеличена до двух человек. Заслушан доклад Календарной комиссии.

Во второй день работы Собор рассматривает вопросы, связанные с приходами Сочинской и Кубанской епархии, обсуждает границы епархий. Участники заседаний заслушают отчёты общецерковных комиссий, поговорят об издании Соборных решений, порядке обжалования прещений и о других вопросах церковной жизни.